Please use this identifier to cite or link to this item: http://doi.org/10.25358/openscience-3255
Authors: Reinartz, Ricarda
Title: Escherichia coli alpha-Hämolysin: Untersuchungen zur Struktur und Porenbildung
Online publication date: 26-Jan-2009
Year of first publication: 2009
Language: german
Abstract: Escherichia coli α-Hämolysin (HlyA) ist ein Prototyp der RTX-Toxine, die zu den α-porenbildenden Toxinen gehören. HlyA bildet Poren in einer Vielzahl eukaryontischer Zielzellen. Das 107 kDa große Protein besteht aus 1024 Aminosäuren, die gemeinsam mit den Proteinen für posttranslationale Modifikation und Sekretion in einem Operon codiert werden. Die N-terminale Hälfte von HlyA besteht aus mehreren amphipathischen α –Helices, die mit der Porenbildung assoziiert werden, gefolgt von der Calcium-bindenden RTX-Domäne in der C-terminalen Hälfte des Moleküls. Über den porenbildenen Mechanismus ist wenig bekannt. Die vorliegende Arbeit fokussierte sich auf die Frage, ob dieser Prozess eine Oligomerisierung mehrerer HlyA-Moleküle beinhaltet, oder ob die membranschädigende Struktur von einem Monomer gebildet wird. Drei unabhängige biochemische Methoden wurden in dem Versuch eingesetzt, HlyA-Oligomere in permeabilisierten Membranen zu detektieren. In allen drei Ansätzen wurden negative Ergebnisse erreicht, was das Konzept bestätigt, dass die Pore von HlyA von einem Monomer gebildet wird. PCR-basierte Cysteinsubstitutionen wurden durchgeführt, um den N-terminus von HlyA zu charakterisieren. Einzelne Cysteinreste wurden an 21 Positionen innerhalb der Aminosäuresequenz 13-55 eingeführt, und mit dem umgebungssensitiven Fluorophor Badan markiert. Spektrofluorimetrische Messungen zeigten, dass alle untersuchten Aminosäuren innerhalb dieser Domäne unabhängig von der porenbildenden Aktivität in die Membran inserieren. Deletionen der Aminosäuren 1-50 hatten keinen Einfluß auf die lytische Aktivität, während die Deletion der Aminosäuren 1-100 in einer fast vollständig inaktiven Toxinmutante resultierte. r Die Einführung von Prolinen durch PCR-basierte Mutagenese wurde durchgeführt, um die Beteiligung vorhergesagter α-Helices innerhalb der N-terminalen Hälfte von HlyA an der hämolytischen Aktivität zu untersuchen. Die Ergebnisse deuten darauf hin, dass die Struktur von mindestens vier vorhergesagten Helices bedeutend für die hämolytische Aktivität ist.
Escherichia coli α-hemolysin (HlyA) is a prototype of RTX-toxins belonging to α-pore forming toxins. HlyA formes pores in a wide range of eucaryotic target cells. The 107 kDa protein is composed of 1024 amino acids encoded in an operon together with proteins for posttranslational modification and secretion. The N-terminal domain of HlyA harbours a series of amphipathic α-helices that are associated with pore formation, which is followed by calcium-binding RTX-domain in the C-terminal half of the molecule. Little is known about the mechanism of pore formation. The present study was focussed on the question if this process includes oligomerization of several HlyA molecules, or if the membrane pertubating structure is formed by a monomer. Three independent biochemical approaches were employed in an effort to detect HlyA-oligomers in permeabilized membranes. Negative results were obtained in every case, in line with the concept that the pore generated by HlyA is monomeric. Cysteine scanning mutagenesis was performed to characterize the N-terminus of the molecule. A single cysteine residue was introduced at 21 positions within the sequence spanning residues 13-55 and labeled with the polarity-sensitive dye badan. Spectrofluorimetric analyses indicated that amino acids in this domain insert into the lipid bilayer, and that this insertion is independent from pore forming activity. Deletion of amino acids 1-50 did not affect lytic activity, while deletion of amino acids 1-100 resulted in a nearly inactive toxin-mutant. Introduction of two prolines using PCR based mutagenesis was employed to investigate the contributions to hemolysis of predicted α-helices within the N-terminal half of HlyA. Results suggest that structural integrity of at least four predicted helices is important for haemolytic activity.
DDC: 570 Biowissenschaften
570 Life sciences
Institution: Johannes Gutenberg-Universität Mainz
Department: FB 10 Biologie
Place: Mainz
ROR: https://ror.org/023b0x485
DOI: http://doi.org/10.25358/openscience-3255
URN: urn:nbn:de:hebis:77-18760
Version: Original work
Publication type: Dissertation
License: In Copyright
Information on rights of use: https://rightsstatements.org/vocab/InC/1.0/
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