Authors:	Keller, Ksenia
Title:	Proteomics-driven approach for the detection of breast cancer biomarkers
Online publication date:	4-Jun-2013
Year of first publication:	2013
Language:	english
Abstract:	Breast cancer (BC) is the most often diagnosed cancer entity of women worldwide. No molecular biomarkers are usable in the clinical routine for the early detection of BC. Proteomics is one of the dynamic tools for the successful examination of changes on the protein level. In this thesis different proteomics-based investigations were performed for the detection of protein and autoantibody biomarkers in serum samples of BC and healthy (CTRL) subjects. First, protein levels of candidates from previous profiling studies were investigated via antibody-microarray platform. Three proteins were found in distinct levels in both groups: secretoglobin family 1D member 1, alpha-2 macroglobulin and inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain family member 4. The second part was dedicated to the de novo exploration of potentially immunogenic tumor antigens (TA-) with immunoprecipitation and Western immunoblotting followed by identification over mass spectrometry. Autoantibody levels were verified in individual serum profiling via the protein microarray platform. Two autoantibodyâ cohorts (anti-Histone 2B and anti-Recoverin) were found in different levels in both groups. The findings of this PhD thesis underline deregulated serum protein and autoantibody levels in the presence of BC. Further investigations are needed to confirm the results in an independent study population. Das Mammakarzinom (MK) ist die häufigste diagnostizierte Krebsart der Frau weltweit. Keine molekularen Biomarker zur Frühentdeckung von MK sind momentan verfügbar in der klinischen Routine. Proteomik ist ein dynamisches Werkzeug für Untersuchung von Veränderungen auf der Protein-Ebene. In dieser Dissertation wurden verschiedene Proteomik-basierte Untersuchungen zur Detektion von Protein und Autoantikörper-Biomarkern im Serum von MK und gesunden (KTRL) Probandinnen eingesetzt. Zunächst wurden die Levels von Protein-Biomarker-Kandidaten überwiegend aus den früheren Studien mittels der Antikörper-Mikroarray-Plattform untersucht. Von folgenden drei Proteinen wurden verschiedene Level in den beiden Gruppen ermittelt: secretoglobin family 1D member 1, alpha-2 macroglobulin und inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain family, member 4. In dem zweiten Teil wurde das de novo Profiling von putativ immunogenen Tumor-Antigenen (TA) mittels Immunpräzipitation und Western Immunblotting mit Identifizierung über Massenspektrometrie angestrebt. Die Level der entsprechenden Autoantikörper wurden in einem individuellen Serum Profiling mittels Protein Mikroarray-Plattform überprüft. Zwei Autoantikörper-Kohorten (anti-Histon 2B und anti-Recoverin) wurden in verschiedenen Level in beiden Gruppen ermittelt. Die Ergebnisse dieser Dissertation unterstreichen fehlregulierte Protein und Autoantikörper Levels im Serum beim MK. Weitere Untersuchungen sind notwendig zur Bestätigung der Ergebnisse in einer unabhängigen Studienpopulation.
DDC:	570 Biowissenschaften 570 Life sciences
Institution:	Johannes Gutenberg-Universität Mainz
Department:	FB 10 Biologie
Place:	Mainz
ROR:	https://ror.org/023b0x485
DOI:	http://doi.org/10.25358/openscience-2723
URN:	urn:nbn:de:hebis:77-34453
Version:	Original work
Publication type:	Dissertation
License:	In Copyright
Information on rights of use:	https://rightsstatements.org/vocab/InC/1.0/
Extent:	134 S.
Appears in collections:	JGU-Publikationen