Autoren:	Mier, Pablo Andrade, Miguel
Titel:	CABRA: cluster and annotate BLAST results algorithm
Online-Publikationsdatum:	23-Mai-2022
Erscheinungsdatum:	2016
Sprache des Dokuments:	Englisch
Zusammenfassung/Abstract:	Background Basic local alignment search tool (BLAST) searches are frequently used to look for homologous sequences and to annotate a query protein, but the increasing size of protein databases makes it difficult to review all results from a similarity search. Findings We developed a web tool called Cluster and Annotate Blast Results Algorithm (CABRA), which enables a rapid BLAST search in a variety of updated reference proteomes, and provides a new way to functionally evaluate the results by the subsequent clustering of the hits and annotation of the clusters. The tool can be accessed from the following web-resource: http://cbdm-01.zdv.uni-mainz.de/~munoz/CABRA. Conclusions Cluster and Annotate Blast Results Algorithm simplifies the analysis of the results of a BLAST search by providing an overview of the result’s annotations organized in clusters that can be iteratively modified by the user.
DDC-Sachgruppe:	570 Biowissenschaften 570 Life sciences
Veröffentlichende Institution:	Johannes Gutenberg-Universität Mainz
Organisationseinheit:	FB 10 Biologie
Veröffentlichungsort:	Mainz
ROR:	https://ror.org/023b0x485
DOI:	http://doi.org/10.25358/openscience-7024
Version:	Published version
Publikationstyp:	Zeitschriftenaufsatz
Nutzungsrechte:	CC BY
Informationen zu den Nutzungsrechten:	https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Zeitschrift:	BMC Research Notes 9
Seitenzahl oder Artikelnummer:	Art. 253
Verlag:	BioMed Central
Verlagsort:	London
Erscheinungsdatum:	2016
ISSN:	1756-0500
URL der Originalveröffentlichung:	http://dx.doi.org/10.1186/s13104-016-2062-y
DOI der Originalveröffentlichung:	10.1186/s13104-016-2062-y
Anmerkung:	Andrade, Miguel veröffentlicht unter: Andrade-Navarro, Miguel A.
Enthalten in den Sammlungen:	DFG-OA-Publizieren (2012 - 2017)