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http://doi.org/10.25358/openscience-6135
Autoren: | Barthels, Fabian Schirmeister, Tanja Kersten, Christian |
Titel: | BANΔIT: B’-factor analysis for drug design and structural biology |
Online-Publikationsdatum: | 29-Jun-2021 |
Erscheinungsdatum: | 2021 |
Sprache des Dokuments: | Englisch |
Zusammenfassung/Abstract: | The analysis of B-factor profiles from X-ray protein structures can be utilized for structure-based drug design since protein mobility changes have been associated with the quality of protein-ligand interactions. With the BANΔIT (B’-factor analysis and ΔB’ interpretation toolkit), we have developed a JavaScript-based browser application that provides a graphical user interface for the normalization and analysis of B’-factor profiles. To emphasize the usability for rational drug design applications, we have analyzed a selection of crystallographic protein-ligand complexes and have given exemplary conclusions for further drug optimization including the development of a B’-factor-supported pharmacophore model for SARS CoV-2 main protease inhibitors. BANΔIT is available online at https://bandit.uni-mainz.de. The source code can be downloaded from https://github.com/FBarthels/BANDIT. |
DDC-Sachgruppe: | 570 Biowissenschaften 570 Life sciences |
Veröffentlichende Institution: | Johannes Gutenberg-Universität Mainz |
Organisationseinheit: | FB 09 Chemie, Pharmazie u. Geowissensch. |
Veröffentlichungsort: | Mainz |
ROR: | https://ror.org/023b0x485 |
DOI: | http://doi.org/10.25358/openscience-6135 |
Version: | Published version |
Publikationstyp: | Zeitschriftenaufsatz |
Nutzungsrechte: | CC BY |
Informationen zu den Nutzungsrechten: | https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ |
Zeitschrift: | Molecular informatics 40 1 |
Seitenzahl oder Artikelnummer: | 2000144 |
Verlag: | Wiley-VCH |
Verlagsort: | Weinheim |
Erscheinungsdatum: | 2021 |
ISSN: | 1868-1751 |
URL der Originalveröffentlichung: | https://doi.org/10.1002/minf.202000144 |
DOI der Originalveröffentlichung: | 10.1002/minf.202000144 |
Enthalten in den Sammlungen: | JGU-Publikationen |
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