Bitte benutzen Sie diese Kennung, um auf die Ressource zu verweisen: http://doi.org/10.25358/openscience-6135
Autoren: Barthels, Fabian
Schirmeister, Tanja
Kersten, Christian
Titel: BANΔIT: B’-factor analysis for drug design and structural biology
Online-Publikationsdatum: 29-Jun-2021
Erscheinungsdatum: 2021
Sprache des Dokuments: Englisch
Zusammenfassung/Abstract: The analysis of B-factor profiles from X-ray protein structures can be utilized for structure-based drug design since protein mobility changes have been associated with the quality of protein-ligand interactions. With the BANΔIT (B’-factor analysis and ΔB’ interpretation toolkit), we have developed a JavaScript-based browser application that provides a graphical user interface for the normalization and analysis of B’-factor profiles. To emphasize the usability for rational drug design applications, we have analyzed a selection of crystallographic protein-ligand complexes and have given exemplary conclusions for further drug optimization including the development of a B’-factor-supported pharmacophore model for SARS CoV-2 main protease inhibitors. BANΔIT is available online at https://bandit.uni-mainz.de. The source code can be downloaded from https://github.com/FBarthels/BANDIT.
DDC-Sachgruppe: 570 Biowissenschaften
570 Life sciences
Veröffentlichende Institution: Johannes Gutenberg-Universität Mainz
Organisationseinheit: FB 09 Chemie, Pharmazie u. Geowissensch.
Veröffentlichungsort: Mainz
ROR: https://ror.org/023b0x485
DOI: http://doi.org/10.25358/openscience-6135
Version: Published version
Publikationstyp: Zeitschriftenaufsatz
Nutzungsrechte: CC BY
Informationen zu den Nutzungsrechten: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Zeitschrift: Molecular informatics
40
1
Seitenzahl oder Artikelnummer: 2000144
Verlag: Wiley-VCH
Verlagsort: Weinheim
Erscheinungsdatum: 2021
ISSN: 1868-1751
URL der Originalveröffentlichung: https://doi.org/10.1002/minf.202000144
DOI der Originalveröffentlichung: 10.1002/minf.202000144
Enthalten in den Sammlungen:JGU-Publikationen

Dateien zu dieser Ressource:
  Datei Beschreibung GrößeFormat
Miniaturbild
barthels_fabian-banδit__b’-fac-20210628203840983.pdf4.85 MBAdobe PDFÖffnen/Anzeigen